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peaceevenBiotechnology

Oct 4, 2013 (3 years and 10 months ago)

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STAGE INGENIEUR 3
ème

ANNEE
-

ESIL Biotechnologie


ANNEE

:
2003

PROMO

: 26






OPTION

: Bioinformatique

Elève (nom, Prénom)

: PINAUD

Benjamin


Nom de l’entreprise

:
PROSKELIA PHARMACEUTICALS


Adresse

: 102 route de noisy

93230 ROMAINVILLE

France

Maîtr
e de stage

:
Teresa Garcia (Head of targets discovery) / William Newel (head of bioinformatics)

Tél

:

e
-
mail

:
teresa.garcia@proskelia.com

Sujet

:
Interprétation de données de puces à ADN. Réalisation d’une base de donnée, et de
programmes de visualisati
on des données, programmation diverse.




RESUME

:



L’équipe qui m’a accueilli est chargée de la découverte de nouvelles cibles thérapeutiques, c’est à dire de
détecter des gènes sur exprimés ou sous exprimés dans des modèles cellulaires et des contextes

expérimentaux caractéristiques de pathologies de l’os. Ce travail de recherche de gènes d’intérêt a été
réalisé grâce à un protocole massif de puces à ADN, qui a débuté sur une plate
-
forme Affymetrix en 1999.
Actuellement, l’équipe de «

Target discovery

»

compte 4 personnes, dont un bioinformaticien que j’ai
secondé pendant ces six mois de stage. Actuellement, la bioinformatique se charge de la réalisation d’une
base de données (BBDB

: Bone Biologie DataBase) qui réuni les résultats les plus relevant, prod
uits suite
aux différentes expériences de puces à ADN. Des expériences sur plate
-
forme Affymetrix sont encore
quotidiennement réalisées, certaines encore pour identifier de nouvelles cibles ou pour confirmer certaines
cibles déjà identifiées, d’autres pou
r épauler les travaux de validation de cibles.


Programmation

: Java, PHP, Perl, JSP

Base de données

: Oracle / JDS


Condition du stage

:

Bon encadrement, bonne ambiance, équipe dynamique, bioinfo peu développée dans la société,
inconvénient car on doit gé
rer des problème d’informatique pure, avantage car on touche à tout.


Rémunération

:

600 euros

par mois, et remboursement à 100% de la carte de transport. Possibilité d’un supplément de
salaire si le stagiaire est contraint de conserver de louer deux logem
ent à la fois.



























Mots clés

: Programmation, génomique, Puces à ADN



Techniques

: Puces, Annotation, Bases de données, Interfaces Web.






Les informations indiquées ci
-
dessus ne doivent pas être confidentielles.

Ce document es
t appelé à être diffusé au sein de l’Ecole.