Mise en page 1 - Canceropôle PACA

cakefloatBiotechnology

Feb 19, 2013 (4 years and 4 months ago)

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Pourquoi un inventaire
des plateformes de recherche en Sciences du Vivant ?
Pendant longtemps la physique a eu l'exclusivité d'équi pements lourds, la biologie se
contentant, schématiquement, de pipettes et boites de pétri. Ce schéma a commencé à
évoluer dans les années 80, et il y a dix ans environ, l'avènement de la génomique a fait
exploser les besoins en équi pement lourd des biologistes. Il est vite devenu très clair
que chaque l aboratoi re ne pourrai t pas s'octroyer l'ensembl e des équi pements
nécessai res à sa recherche, et qu'i l fal l ai t donc fédérer l es moyens.
L’effort de fédération initié dans le cadre des Instituts Fédératifs de Recherche (IFR)
a permis aux plateaux techniques et plateformes installés dans les laboratoires de
mutual i ser l ’ acqui si t i on d’ équi pements et de moyens humai ns, et d’ uni r l eur s
expertises et leurs compétences pour améliorer les services rendus dans la conduite
de proj ets sci enti fi ques.
Cependant, certaines approches à haut débit ou hautement spécialisées ne pouvant être
subventionnées qu'au niveau national, une dynamique permettant l'émergence de plate-
formes de haut niveau était initiée en 2000 par le Réseau National des Génopoles (RNG).
La région PACA a été parmi les pionniers de cette initiative, et a groupé ses plateformes
au sein d'un Groupement d'Intérêt Scientifique, le GIS Marseille-Nice Génopole
®
.
En 2007, le RNG a été dissous à la création du réseau IBiSA (Infrastructures en Biologie
Santé et Agronomie). Les plateformes IBiSA ont pour vocation de servir la communauté
scientifique en proposant leurs équipements et leur savoir-faire. Elles garantissent la
qualité des résultats fournis aux scientifiques académiques ou venant du privé, obtenus
dans le cadre de collaborations, de co-financements ou de services payés.
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Le document édité en février 2009, à l’occasion de la première journée régionale dédiée
aux plateformes SDV, se veut la représentation la plus exhaustive possible de l’ensemble
des expertises recensées. Il constitue une base d’informations qui sera progressivement
affinée et structurée grâce à la coopération entre les établissements et acteurs concernés.
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Ce premier recensement a été conduit conjointement par le Génopôle et le Canceropôle PACA
(qui avaient antici pé une coordination des plateformes dans le cadre leurs activités
respectives), avec le soutien des responsables des principaux établissements de recherche
de la Région.
La coordination régionale IBiSA, qui devrait se mettre en place dans le courant de l’année
2009 a l’ambition de poursuivre ce travail d’intégration et de coopération, et s’est fixée
les objectifs spécifiques suivants : valoriser auprès des partenaires académiques
et industriels les plateformes labellisées IBiSA
 accompagner les plateaux techniques qui souhaitent
s’engager dans cette voie de labellisation,
 susciter des regroupements entre plateaux techniques candidats
à la labellisation dans une perspective d’objectifs communs
et d’investissements partagés
 mener les actions de promotion des plateformes en partenariat
avec l’ensemble des acteurs institutionnels concernés
(Pôles de compétitivité, structures de valorisation, structures
de promotion pour le développement économique etc…)
Cette ambition de concertation et de coordination des plateformes prendra tout son sens
si elle contribue à accroître la visibilité et la professionnalisation des plateformes
biologiques, gage de leur attractivité auprès de partenaires et utilisateurs publics ou
privés, français ou étrangers, au service d’une dynamique régionale de développement
scientifique et technologique.
Christian Cambillau
,
Directeur de Marseille-Nice Génopole
Christian Chabannon
,
Coordonnateur des Tumorothèques et Plateformes du Canceropôle PACA
Jean-Paul Borg
,
Coordonnateur scientifique du Canceropôle PACA
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Plateformes PACA en sciences du vivant
Plateformes de microbiologie
Plateforme de fermentation et de culture de microorganismes : M. Bruschi
Plateforme régionale de cytometrie pour la microbiologie : G. Regori / M. Denis
Plateformes de biologie végétale
Plateforme de Phytotechnologie : F. Gibiat
Plateformes de génomique
Plateforme de Génomique et transcriptomique : D. Parzy
Plateforme de MicroBioGénomique : D. Raoult / M. Drancourt
Laboratoire de technologies avancées pour le génome et la clinique : C. Nguyen
Plateforme de génomique fonctionnelle de C. elegans : J. Ewbank
Plateformes transcriptome
Laboratoire de Cytogénétique oncologique : M. Chaffanet
Plateforme Transcriptome, Nice : P. Barbry
Plateforme Transcriptome, Marseille : F. Bertucci
Plateforme Transcriptome, Nice : A. Bernard
Laboratoire de Génétique Moléculaire des Hémopathies Malignes : J. Gabert
Laboratoire de Cytogénétique des Hémopaties malignes : S. Raynaud
Plateformes de protéomique analytique et quantitative,
production d’anticorps
Plateforme de Protéomique, MaP : JP Borg/ JP Gorvel
Plateau d’imagerie Protéomique, MaP : D. Braguer
Plateforme ACM Production d’anticorps monoclonaux : M. Pierres
Plateforme de Génomique Structurale : C. Cambillau
Plateforme de Spectrométrie de Résonance Paramagnétique Electronique (RPE) : B. GuigliarellI
Plateformes d’exploration fonctionnelle
Plateforme de transgenèse et d'exploration fonctionnelle de la souris : B. Malissen
Plateforme Modèles murins d’analyse interaction hôte-tumeur (MuCip) : AM Schmitt-Verhulst
Station de Primatologie : G. Dubreuil
Animalerie-Chirurgie : I. Balansard
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Plateformes d’imagerie
Imagerie cellulaire
ImaRIONice : C. Rouvière
Plateforme PRISM (Plateau de Ressources en Imagerie Scientifique et Microscopie) : S. Noselli
Plateforme d'Imagerie Commune au site de Luminy (PICsL) : P. Pierre / X
Imagerie in vivo
Plateforme d’Interaction moléculaire en milieu vivant (IM2V) : D. Marguet
Plateforme d’IRM de Marseille : JL. Anton / B. Poucet
Plateforme d’Imagerie de l’Animal et de l’Homme par Résonance Magnétique : P. Cozzone
Plateforme d’imagerie SPECT-CT du petit animal : P. Franken
Plateforme de Bio informatique
Plateforme PACA- BioInfo : JM Claverie
Plateformes d’essais pré-cliniques : Évaluation de nouvelles thérapies
Plateforme TrGET : Y. Collette
Plateforme d’Innovation Moléculaire à Visée Thérapeutique (IMVT) : C. Béclin
Plateforme Résonance Magnétique Nucléaire : F. Guerlesquin,
Plateforme INT-3D Interaction Dynamic and Drug Design : X. Morelli
Plateforme de criblage Marseille-Luminy : JC. Guillemot
Plateformes de transfert vers la clinique
Plateforme de Pathologie Moléculaire : D. Figarella-Branger
Plateforme de pathologie clinique et expérimentale : P. Hofman
Laboratoire d’Oncologie Biologique et Transfert : PM. Martin / L. Ouafik
Laboratoire de Transfert : F. Pedeutour
Centre de thérapie cellulaire et génique : C. Chabanon
Plateforme d’Immunomonitoring en cancérologie : D.Olive
Plateforme GeneOnE : Génétique Oncologique et Endocrinienne : H. Sobol / T. Noguchi
Plateforme GeneOnE : Génétique Oncologique et Endocrinienne : A. Barlier / A. Enjalbert
Laboratoire de MagnétoEncéphaloGraphie : P. Chauvel
Plateforme de recherche clinique - Centre de traitement de données : P. Viens
Réseau des tumorothèques PACA
Tumorothèques de l’Assistance Publique des Hôpitaux de Marseille : D. Figarella-Branger
Tumorothèque commune du CHU de Nice et du Centre Antoine Lacassagne : P. Hofman
Tumorothèque de l’Institut Paoli-Calmettes : C. Chabannon
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- Castelle, C. et al. A new iron-oxidizing/O2-reducing supercomplex spanning both inner and outer membranes, isolated
from the extreme acidophile Acidithiobacillus ferrooxidans. J.Biol.Chem 283(38):25803-25811(sept.2008)
- Pelletier, N.et al. First characterisation of the active oligomer form of sulfur oxygenase reductase from bacterium
Aquifex aeolicus. Extremophiles 12(2):205-215(mars 2008)
- Duquesne, K. et al. Arsenite oxidation by a chemoautotrophic moderately acidophilic Thiomonas sp. : from the strain
isolation to the gene study. Environmental Microbiology 10(1):228-237(jan.2008)
- Giuliani, M-C. et al. A new sulfurtransferase from the hyperthermophilic bacterium Aquifex aeolicus. FEBS 274(17):4572-
4587(aout 2007)
- Fernandez-Tornero, C. et al. Insights into transcription initiation and termination from the electron microscopy
structure of yeast RNA Polymerase III. Molecular Cell 25(6):813-823(mars 2007)
- Betzi, S. et al. Protein protein interaction inhibition (2P2I) combining high throughput and virtual screening : Application
to the HIV-1 Nef protein. Proc Natl Acad Sci USA 104(49) :19256-61(2007)
- Bailly, M. et al. A single tRNA base pair mediates bacterial tRNA-dependent biosynthesis of asparagine. Nucleic Acids
Research 34(21) :6083-6094(oct.2006)
- Goulhen, F. et al. Cr(VI) detoxification by Desulfovibrio vulgaris
strain Hildenborough : microbe-metal interactions studies. Applied Microbiology and Biotechnology 71(6):892-897(aout
2006)
- Pieulle, L. et al. The Type I / Type II cytochrome c3 complex : an electron transfer link in the hydrogen-sulfate reduction
pathway. Journal of Molecular Biology 354(1):73-90(nov.2005)
- Lieutaud, C. et al. Study of the high potential iron sulfur protein in Halorhodospira halophila confirms that it is distinct
from cytochrome c as electron carrier. Proc Natl Acad Sci USA 102(9) :3260-3265(mars 2005)
- Mingardon, F. et al. Heterologous production, assembly, and secretion of minicellulosome by Clostridium
acetobutylicum ATCC824. Applied and Environmental Microbiology 71(3):1215-1222(mars 2005)
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Sous forme de contrats de prestation de service
avec des laboratoires CNRS de Grenoble,
Strasbourg, avec des équipes INSERM-Marseille,
avec l’EMBL-Heidelberg, avec l’Institut Monod,
Weizmann-Institut, avec l’université de
Lisbonne…
Au travers des projets de collaboration d’équipes
de l’IMM :
TOTAL-bioénergies/ LCB/UPR9043CNRS :
cultures de Clostridium acetobutylicum
VEOLIA-Environnement/BIP-UPR9036CNRS
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Page 2 sur 2Plateforme de fermentation et de culture de microorganismes
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Duhamel S., Grégori G., Mauriac R., Van wambeke F., Nedoma J. (2008) A method for analysing phosphatase activity in
aquatic bacteria at the single cell level using flow cytometry. J Microbiol Methods 75, 269–278.
Duhamel S., Grégori G., Van Wambeke F., and Nedoma J. Detection of extracellular phosphatase activity at the single cell
level by enzyme-labelled fluorescence and flow cytometry : the importance of time kinetics in ELFA labelling. Cytometry
(sous-presse).
Fernández I. C., Thyssen M., Denis M. (2008) Microbial community structure along 18°W (39°N – 44.5°N) in the NE
Atlantic in late summer 2001 (POMME programme). J. Mar. Syst. 71 : 46-62.
Karayanni H., Christaki U., Van Wambeke F., Thyssen M., Denis M.(2008). Heterotrophic nanoflagellate and ciliate
bacterivorous activity and growth in oceanic waters : a seasonal study at mesoscale in NE Atlantic. Aquatic Microbial
Ecology, 51:169-181.
Rakotomalama, L., Studach, L., Wang, W., Grégori, G., Hullinger, R.L., Andrisani, O., (2008) Hepatitis B virus X protein
increases the Cdt 1 to to geminin ratio inducing DNA re-replication and polyploidy. J. Biol. Chem (sous-presse).
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- Laboratoires de la Région (DIMAR UMR 6540,
LMGEM UMR 6117 du Centre d’Océanologie de
Marseille ; LCB UPR9043 ; MAPIEM-EA 4323 de
l’Université du Sud Toulon-Var ; unités SYROCO
et CAMELIA de l’IRD)
- Univeristé de Sfax (Tunisie)
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-Laboratoires de la Région (DIMAR UMR 6540,
LMGEM UMR 6117et LOPB UMR 6535 du Centre
d’Océanologie de Marseille ; LCB UPR9043 ;
MAPIEM-EA 4323 de l’Université du Sud Toulon-
Var ; unités SYROCO et CAMELIA de l’IRD
- INSERM-CNRS (Formation Permanente)
- Cours en France (Master I et Master Pro de
l’Université de la Méditerranée) et à l’étranger
(Etats-Unis, Québec, Hongrie, Tunisie, Turquie)
Agence pour la Recherche et la Valorisation
Marines (La Réunion)
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Page 2 sur 2Plateforme régionale de cytometrie pour la microbiologie - PRECYM
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Possibilité d'accueil de projets, après
acceptation d’un projet, un membre de l’équipe
accueillie se formera aux diverses techniques.
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Page 2 sur 2Plateforme génomique et transcriptomique
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La Scola B, Desnues C, Pagnier I, Robert C, Barrassi L, Fournous G, Merchat M, Suzan-Monti M, Forterre P, Koonin E, Raoult
D. - The virophage as a unique parasite of the giant mimivirus. Nature. 2008;455:100-4. [IF = 28,7]
Lescot M, Audic S, Robert C, Nguyen TT, Blanc G, Cutler SJ, Wincker P, Couloux A, Claverie JM, Raoult D, Drancourt M. - The
Genome of Borrelia recurrentis, the Agent of Deadly Louse-Borne Relapsing Fever, Is a Degraded Subset of Tick-Borne
Borrelia duttonnii. – PloS Genet. 2008;4:e1000185. [IF = 8,7]
La Scola B, Elkarkouri K, Li W, Wahab T, Fournous G, Rolain JM, Biswas S, Drancourt M, Robert C, Audic S, Löfdahl S, Raoult
D. - Rapid comparative genomic analysis for clinical microbiology: the Francisella tularensis paradigm. Genome Res.
2008;18 :742-50. [IF = 11,2]
Blanc G, Ogata H, Robert C, Audic S, Claverie JM, Raoult D.- Lateral gene transfer between obligate intracellular bacteria:
evidence from the Rickettsia massiliae genome. Genome Res. 2007;17:1657-64. [IF = 11,2]
Audic S, Robert C, Campagna B, Parinello H, Claverie JM, Raoult D, Drancourt M. - Genome analysis of Minibacterium
massiliensis highlights the convergent evolution of water-living bacteria. PLoS Genet. 2007;3:e138. [IF = 8,7]
Ogata H, La Scola B, Audic S, Renesto P, Blanc G, Robert C, Fournier PE, Claverie JM, Raoult D. - Genome sequence of
Rickettsia bellii illuminates the role of amoebae in gene exchanges between intracellular pathogens. PLoS Genet.
2006;2:e76. [IF = 8,7]
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Oui: collaborations régionales, nationales et
internationales
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Page 2 sur 2Plateforme MicroBioGénomique
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S. Simoncini, N. K. Njock, S. Robert, L. Camoin-Jau, J. Sampol, C. Nguyen, F. Dignat-George, and F. Anfosso.
TRAIL/APO2L mediates the release of procoagulant endothelial microparticles induced by thrombin: a novel mechanism
linking
inflammation and coagulation. Blood 2008.(In Press).
Lopez, P., Textoris, J., Bergon, A., Granjeaud, S., Didier, J., Remy, E., Imbert, J., Nguyen, C. and Puthier, D.
TBrowser: a new tool to productively mine thousands of transcriptional signatures derived from public microarray
experiments.
PLoS ONE, 3 (12):e4001, 2008.
N. F. Delahaye, N. Coltel, D. Puthier, M. Barbier, P. Benech, F. Joly, F. A. Iraqi, G. E. Grau, C. Nguyen, and P. Rihet.
Gene expression analysis reveals early changes in several molecular pathways in cerebral malaria-susceptible mice
versus cerebral malaria-resistant mice. BMC.Genomics 8 (1):452, 2007.
Bertucci F, Pages C, Finetti P, Rochaix P, Lamant L, Devilard E, Nguyen C, Houlgatte R, Birnbaum D, Xerri L, Brousset P.
Gene
expression profiling of human melanoma cell lines with distinct metastatic potential identifies new progression markers.
Anticancer Res. 2007 Sep-Oct;27(5A):3441-9.
Shanker anil, verdeil G, Bufern M, Inderberg- Suso E-M, Puthier D, Joly F, Nguyen C, leserman L, Auphan-Anezin N,and AM
Schmitt-verhulst. CD8 T cell help for innate anti-tumor immunity J Immunol, 2007, 15;179(10):6651-62.
Talby L, Chambost H, Roubaud MC, N'Guyen C, Milili M, Loriod B, Fossat C, Picard C, Gabert J, Chiappetta P, Michel G,
Schiff
C.The chemosensitivity to therapy of childhood early B acute lymphoblastic leukemia could be determined by the
combined
expression of CD34, SPI-B and BCR genes. Leuk Res. 2006 Jun;30(6):665-76.
Bertucci F, Finetti P, Rougemont J, Charafe-Jauffret E, Cervera N, Tarpin C, Nguyen C, Xerri L, Houlgatte R, Jacquemier J,
Viens P, Birnbaum D. Gene expression profiling identifies molecular subtypes of inflammatory breast cancer.Cancer Res.
2005 Mar 15;65(6):2170-8.
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Le personnel de la plate-forme assure l’accueil
et le suivi des projets qui peuvent accéder
aux prestations de la plate-forme à différents
niveaux
sous forme de service et de collaboration
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Les utilisateurs voulant accéder à la plate-forme
doivent remplir une demande spécifique qui est
examinée et validée par le conseil de direction
de la plate-forme avant la prise en charge du
projet
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Page 2 sur 2Laboratoire technologies avancées pour le génome et la clinique
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1- Couillault et al (2004) TLR-independent control of innate immunity in Caenorhabditis elegans by the TIR domain
adaptor protein TIR-1, an ortholog of human SARM. Nature Immunol, 5, 488.
2- Schulenburg and Ewbank (2004) Diversity and specificity in the interaction between Caenorhabditis elegans and the
pathogen Serratia marcescens. BMC Evol Biol, 4, 49.
3- Cardoso et al (2005) XNP-1/ATR-X acts with RB, HP1 and the NuRD complex during larval development in C. elegans.
Dev Biol, 278, 49-59.
4- Wong et al (2007) Genome-wide investigation reveals pathogen-specific and shared signatures in the response of C.
elegans to infection. Genome biology 8, R194
5- Duverger et al. (2007). A semi-automated high-throughput approach to the generation of transposon insertion
mutants in the nematode Caenorhabditis elegans. Nucleic Acids Res 35, e11
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La plate-forme a réalisé des projets pour les
équipes marseillaises
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Projet subventionné par la Région avec ModulBio
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(sous forme de contrats de prestation de service
ou de conventions) pour multiples équipes en
France, Europe (FP6 ; Angleterre, Grèce,
Allemagne) et les Etats Unis.
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Page 2 sur 2Plateforme de Génomique fonctionnelle de C. elegans
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Début d’activité de la plateforme: décembre 2006
Integrated Profiling of Basal and Luminal Breast Cancers
Jose´ Ade´la
ı¨de,1 Pascal Finetti,1 Ismahane Bekhouche,1 Laetitia Repellini,1 Jeannine Geneix,1
Fabrice Sircoulomb,1 Emmanuelle Charafe-Jauffret,1,2,4 Nathalie Cervera,1 Je´roˆme Desplans,5
Daniel Parzy,5 Eric Schoenmakers,6 Patrice Viens,3,4 Jocelyne Jacquemier,1,2
Daniel Birnbaum,1 Franc¸ois Bertucci,1,3,4 and Max Chaffanet
Rearrangements involving 12q in myeloproliferative disorders:
possible role of HMGA2 and SOCS2 genes
Anne Etiennea, Nadine Carbucciaa, Jose´ Ade´laı¨dea, Ismahane Bekhouchea, Virginie Re´mya,
Claudine Sohnb, Danielle Saintyc, Jean-Albert Gastautd, Sylviane Olschwanga,c,
Daniel Birnbauma, Marie-Joe¨lle Mozziconaccia,c,*, Max Chaffanet
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Page 2 sur 2Laboratoire de Cytogénétique oncologique
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1. Colell A*, Ricci JE*, Tait S, Milasta S, Maurer U, Bouchier-Hayes L, Fitzgerald P, Guio-Carrion A, Waterhouse NJ, Wei Li
C, Mari B, Barbry P, Newmeyer DD, Beere HM, Green DR. Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase and autophagy
preserve cellular survival following apoptotic cytochrome c release in the absence of caspase activation. 2007. Cell. In
press.
2. Le Brigand K, Barbry P. “Mediante: a Web-based Microarray Data manager”. 2007. Bioinformatics. March 23. PMID:
17384016
3. Fitsialos G, Chassot AA, Turchi L, Dayem MA, Moreilhon C, Meneguzzi G, Busca R, Mari B, Barbry P, Ponzio G.
Transcriptomal signature of epidermal keratinocytes after a scratch test reveals selective roles for Erk, p38 and PI3K
signalling pathways during wound closure. 2007. Journal of Biological Chemistry. March 14. PMID: 17363378.
4. Triboulet R, Mari B, Lin YL, Chable-Bessia1 C, Bennasser Y, Le Brigand K, Cardinaud B, Barbry P, Baillat V, Reynes J,
Corbeau P, Jeang KT, Benkirane M. Physiological suppression of the microRNA-silencing pathway by HIV-1 is required for
virus replication. 2007. Science, 315:1579-1582
5. Albrecht V, Chevallier A, Magnone V, Barbry P, Vandenbos F, Bongain A, Lefebvre JC, Giordanengo V. Easy and fast
detection and genotyping of high-risk human papillomavirus by dedicated DNA microarrays. 2006. J Virol. Methods.
6. Le Brigand K, Russell R, Moreilhon C, Rouillard J-M. Jost B, Amiot F, Magnone V, Bole-Feysot C, Rostagno P, Virolle V,
Defamie V, Dessen P, Williams G, Lyons P, Rios G, Mari B Gulari E, Kastner P, Gidrol X, Freeman TC, Barbry P. An open-
access long oligonucleotide microarray resource for analysis of the human and mouse transcriptomes. Nucleic Acids
Research 2006, 1-13.
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Page 2 sur 2Plateforme Transcriptome
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- BERTUCCI F., FINETTI P., ROUGEMONT J., CHARAFE-JAUFFRET E., NASSER V., LORIOD B., TAGETT R., CAMERLO J., TARPIN
C., HOUVENAEGHEL G., NGUYEN C., MARANINCHI D., JACQUEMIER J., HOULGATTE R., BIRNBAUM D. and VIENS P.
Gene expression profiling for molecular characterization of inflammatory breast carcinomas and prediction of response to
chemotherapy.
Cancer Res., 2004, 64, 8558-8565.
- BERTUCCI F., FINETTI P., ROUGEMONT J., CHARAFE-JAUFFRET E., CERVERA N., TARPIN C., NGUYEN C., XERRI L.,
HOULGATTE R., JACQUEMIER J., VIENS P. and BIRNBAUM D.
Gene expression profiling identifies molecular subtypes in inflammatory breast cancers. Cancer Res., 2005, 65, 2170-
2178.
- Adélaïde J, Finetti P, Bekhouche I, Repellini L Geneix J, Sircoulomb F, Charafe-Jauffret E, Cervera N, Desplans J, Parzy D,
Schoenmakers E, Viens P, Jacquemier J, Birnbaum D, Bertucci F, Chaffanet M. Integrated profiling of basal and luminal A
breast cancers. Cancer Research, 2007, 67(24), 11565-75.
- Finetti P, Cervera N, Charafe-Jauffret E, Chabannon, C, Charpin C, Chaffanet M, Jacquemier J, Viens P, Birnbaum D,
Bertucci F. Sixteen-kinase gene expression identifies luminal breast cancers with poor prognosis. Cancer Research, 2008,
68(3): 767-776.
- BERTUCCI F., FINETTI P., CERVERA N., CHARAFE-JAUFFRET E., MAMESSIER E., ADELAIDE J., DEBONO S., HOUVENAEGHEL
G., MARANINCHI D., VIENS P., CHARPIN C., JACQUEMIER J. and BIRNBAUM D.
Gene expression profiling shows medullary breast carcinoma is a subgroup of basal breast cancer.
Cancer Res., 2006, 66, 4636-4644.
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1- Wakkach A, Fournier N, Brun V, Breittmayer J-P, Cottrez F, Groux H. Characterization of dendritic cells that induce
tolerance and T regulatory 1 cells differentiation in vivo. Immunity, 2003, 28: 1-20
2- Marella, M., Gaggioli, C., Batoz, M., Deckert, M., Tartare-Deckert, S., and Chabry J. Pathological prion protein exposure
switches on neuronal MAP-kinase pathway resulting in microglial recruitment. 2005. J. Biol. Chem. 280:1529-1534
3- Gaggioli, C., Deckert, M., Robert, G., Abbe, P., Batoz, M., Ehrngruber, MU., Ortonne, JP., Ballotti, R., and Tartare-Deckert,
S. HGF induces fibronectin matrix synthesis in melanoma cells through MAP kinase-dependent signaling pathway and
induction of Egr-1. 2005. Oncogene. 24:1423-1433
4- Jacquel, A., Herrant, M., Defamie, V., Belhacene, N., Colosetti, P., Marchetti, S., Legros, L., Deckert, M., Mari, B., Cassuto,
J.P., Hofman, P., and Auberger, P. A survey of the signaling pathways involved in megakaryocytic differentiation of the
human K562 leukemia cell line by molecular and c-DNA array analysis. 2006. Oncogene. 25:781-94.
5- Chassot AA, Truchi L, Virolle T, Fistialos G, Batoz M, Deckert M, Dulic V, Meneguzzi G, Buscà R, Ponzio G. Id3 is a novel
regulator of p27kpp1 mRNA in early G1 phase and is required for cell-cycle progression. Oncogene, 2007, 26(39):5772-83
6- Turchi L, Aberdam E, Mazure N, Pouysségur J, Deckert M, Kitajima S, Aberdam D, Virolle T. Hif-2alpha mediates UV-
induced apoptosis through a novel ATF3-dependent death pathway. Cell Death Diff. 2008, 15(9):1472-80.
7- Hilmi C, Larribere L, Deckert M, Rocchi S, Giuliano S, Bille K, Ortonne JP, Ballotti R, Bertollotto C. Involvement of FKHRL1
in melanoma cell survival and death. Pigment. Cell Melanoma Res, 2008, 21(2):139-46
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8 Equipes partenaires de projets
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9 Entreprises partenaires de projets
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1- Gabert J., Beillard E., van der Velden V.-H., Bi W., Grimwade D., Pallisgaard N., Barbany G., Cazzaniga G., Cayuela J.-M.,
Cave H., Pane F., Aerts J.-L., De Micheli D., Thirion X., Pradel V., Gonzalez M., Viehmann S., Malec M., Saglio G., van Dongen
J.-J. Standardization and quality control studies of 'real-time' quantitative reverse transcriptase polymerase chain
reaction of fusion gene transcripts for residual disease detection in leukemia - a Europe Against Cancer program.
Leukemia. 17:2318-57 ; IF = 6.6 (nombre de citations >150, dans le top 1% de la spécialité).
2 - Beillard E, Pallisgaard N, van der Velden VH, Bi W, Dee R, van der Schoot E, Delabesse E, Macintyre E, Gottardi E, Saglio
G, Watzinger F, Lion T, van Dongen JJ, Hokland P, Gabert J. Evaluation of candidate control genes for diagnosis and
residual disease detection in leukemic patients using 'real-time' quantitative reverse-transcriptase polymerase chain
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Saglio G., Sawyers C., Spinelli O., Van Der Velden V.H.J., Wang J.Q., Zoi K., Patel V., Philips P., Matejtschuk P., and Gabert J.
Leukemia (publication on line Mai 2007)
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IFR + Chercheurs Timone (INSERM)
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Page 2 sur 2Laboratoire de Génétique Moléculaire des Hémopathies Malignes
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1. Sören Lehmann*, Seishi Ogawa*, Sophie D. Raynaud*, Masashi Sanada, Yasuhito Nannya, Michel Ticchioni, Christian
Bastard, Norihiko Kawamata, H. Philli
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leukemia. Cancer. 2008 Mar 15;112(6):1296-305 *The first 3 authors contributed equally to this work
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Leukemia. 2007 May 31; [Epub ahead of print] No abstract available.
4. Desmond JC, Raynaud S, Tung E, Hofmann WK, Haferlach T, Koeffler HP. Discovery of epigenetically silenced genes in
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5. C Picard, S Hayette, C Bilhou-Nabera, J M Cayuela, E Delabesse, N Frenoy, C Preudhomme, M Dupont, C Bastard, D
Bories, J L Vaerman, F Davi, N Dastugue, S Raynaud, M Lafage, F Deschaseaux, T Fest, M P Gaub, V Lhéritier, X Thomas, C
Charrin, C Boucheix, H Dombret, E MacIntyre, D Fière and J Gabert. Prospective multicentric molecular study for poor
prognosis fusion transcripts at diagnosis in adult B-lineage ALL patients: the LALA 94 experience. Leukemia. 2006
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6. N Vey, X Thomas, C Picard, T Kovascovicz, C Charin, J M Cayuela, H Dombret, N Dastugue, F Huguet, C Bastard, A
Stamatoulas, M Giollant, O Tournilhac, E Macintyre, A Buzyn, D Bories, M Kuentz, F Dreyfus, A Delannoy, S Raynaud, N
Gratecos, D Bordessoule, S de Botton, C Preudhomme, O Reman, X Troussard, A Pigneux, C Bilhou, J P Vernant, C Boucheix
and J Gabert. Allogeneic stem cell transplantation improves the outcome of adults with t(1;19)/E2A-PBX1 and
t(4;11)/MLL-AF4 positive B-cell acute lymphoblastic leukemia: results of the prospective multicenter LALA-94 study.
Leukemia. 2006 Dec;20(12):2155-61.
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Page 2 sur 2Laboratoire de Cytogénétique des Hémopathies malignes
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Jean-Paul BORG et Jean-Pierre GORVEL
Institut Paoli Calmettes, CRCM, CIML
Plateforme de Protéomique
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Diane BRAGUER
INSERM, AP-HM, Université de la Mediterranée
Plateforme d'Imagerie Protéomique, MaP
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Marseille Protéomi
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Honoré S, Pagano A, Gauthier G, Bourgarel-Rey V, Verdier-Pinard P, Civiletti K, Kruczynski A, Braguer D.
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(sous presse)
Devred F., Tsvetkov PO, Barbier P, Allegro D; Horwitz SB, Makarov AA, Peyrot V,
Stathmin/Op18 is a novel mediator of vinblastine activityFebs letters sous presse
Ristorcelli E, Beraud E, Verrando P, Villard C, Lafitte D, Sbarra V, Lombardo D, Verine A.
Human tumor nanoparticles induce apoptosis of pancreatic cancer cells.FASEB J. 2008.
Makarov AA, Tsvetkov PO, Villard C, Esquieu D, Pourroy B, Fahy J, Braguer D, Peyrot V, Lafitte D Vinflunine, a novel
microtubule inhibitor, suppresses calmodulin interaction with the microtubule-associated protein STOP.Biochemistry.
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Almeras L, Eyles D, Benech P, Laffite D, Villard C, Patatian A, Boucraut J,Mackay-Sim A, McGrath J, Feron F.
Developmental vitamin D deficiency alters brain protein expression in the adult rat: implications for neuropsychiatric
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Kowalczewska M, Fenollar F, Lafitte D, Raoult D.
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Comte B, Franceschi C, Sadoulet MO, Silvy F, Lafitte D, Benkoel L, Nganga A,Daniel L, Bernard JP, Lombardo D, Mas E.
Detection of bile salt-dependent lipase, a 110 kDa pancreatic protein, in
urines of healthy subjects.
Kidney Int. 2006;69(6):1048-55.
Masi M, Pages JM, Villard C, Pradel E.
The eefABC multidrug efflux pump operon is repressed by H-NS in Enterobacter aerogenes.
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Dupont M, Pages JM, Lafitte D, Siroy A, Bollet C.
Identification of an OprD homologue in Acinetobacter baumannii.
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Outre les équipes du site Timone, ouverture a
tous les Laboratoires publics marseillais par
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6171, et extérieurs INSERM U128, Montpellier
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Page 2 sur 2Plateforme d'Imagerie Protéomique, MaP (Marseille Protéomique)
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Walzer T, Blery M, Chaix J, Fuseri N, Chasson L, Robbins SH, Jaeger S, Andre P, Gauthier L, Daniel L, Chemin K, Morel Y,
Dalod M, Imbert J, Pierres M, Moretta A, Romagne F, Vivier E.
Identification, activation, and selective in vivo ablation of mouse NK cells via NKp46.Proc Natl Acad Sci U S A. 2007 Feb 27;104(9):3384-9. PMID: 17360655 [PubMed - in process]
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Page 2 sur 2Plateforme ACM Productions d'anticorps monoclonaux
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transfer with bacterial and mammalian viruses, Nature Struct Molec Biol, 13, 85-89 (2006)
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Equipes de Marseille, et d’ailleurs via des ANRs
et projets européens (eg Projet Intégré européen
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français avec BioXtal
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Prestations de sevice avec équipes de Marseille
(Facultés de Mèdecine), Françaises et d’ailleurs
Français et européens (eg Ablynx)P
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Page 2 sur 2Plateforme de Génomique Structurale
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1. Apostolaki, M. et al. Role of beta7 Integrin and the Chemokine/Chemokine Receptor Pair CCL25/CCR9 in Modeled TNF-Dependent Crohn's Disease. Gastroenterology (2008).
2. Bartoli, M. et al. Mannosidase I inhibition rescues the human alpha-sarcoglycan R77C recurrent mutation. Hum Mol
Genet 17, 1214-21 (2008).
3. Bursch, L.S. et al. Identification of a novel population of Langerin+ dendritic cells. J Exp Med 204, 3147-56 (2007).
4. Chang, S.Y. et al. Cutting edge: langerin+ dendritic cells in the mesenteric lymph node set the stage for skin and gut
immune system cross-talk. J Immunol 180, 4361-5 (2008).
5. Chiesa, S. et al. Multiplicity and plasticity of natural killer cell signaling pathways. Blood 107, 2364-72 (2006).
6. Genton, C. et al. The Th2 lymphoproliferation developing in LatY136F mutant mice triggers polyclonal B cell activation
and systemic autoimmunity. J Immunol 177, 2285-93 (2006).
7. Ginhoux, F. et al. Blood-derived dermal langerin+ dendritic cells survey the skin in the steady state. J Exp Med 204,
3133-46 (2007).
8. Gommeaux, J. et al. Colitis and colitis-associated cancer are exacerbated in mice deficient for tumor protein 53-induced
nuclear protein 1. Mol Cell Biol 27, 2215-28 (2007).
9. Gregoire, C. et al. Deletion of the LIME adaptor protein minimally affects T and B cell development and function. Eur J
Immunol 37, 3259-69 (2007).
10. Mingueneau, M. et al. The proline-rich sequence of CD3epsilon controls T cell antigen receptor expression on and
signaling potency in preselection CD4+CD8+ thymocytes. Nat Immunol 9, 522-32 (2008).
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La plate-forme a réalisé des opérations de
KO/KI/transgénèse pour les équipes
marseillaises
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Projet important de avec Innate Phama.
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(sous forme de contrats de prestation de service
ou de conventions gérés par l’INSERM) avec des
unités INSERM de Toulouse, avec l’Institut
Pasteur de Paris. La plate-forme fait également
partie du « technological core » du réseau
d’excellence européen MUGEN.En cela elle a été
amené a effectuer des KO/KI pour des
laboratoires travaillant en Italie, Grêce et
Angleterre. La plate-forme a effectué 7 KO/KI
pour des équipes labellisées par l’AFM et le
Généthon.
La plate-forme a travaillé sous forme
contactuelle avec Astra-Zenca et Schering
–Plough.
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Page 2 sur 2Plateforme de transgenèse et d'exploration fonctionnelle de la souris
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, E.M. Inderber
g
-Suso, A.M. Schmitt-Verhulst, A. Berns,
and B.J. Van den Eynde. 2006. An inducible mouse model of melanoma expressing a defined tumor antigen. Cancer Res
66:3278-3286.
*Shanker, A., G. *Verdeil, M. Buferne, E.M. Inderberg-Suso, D. Puthier, F. Joly, C. Nguyen, L. Leserman, N. Auphan-Anezin,
and A.M. Schmitt-Verhulst. 2007. CD8 T cell help for innate antitumor immunity. J Immunol 179:6651-6662.
Irla, M., Saade, M., Kissenpfennig, A., Poulin, L., Leserman, L., Marche, P., Jouvin-Marche, E., Berger, F. and Nguyen, C.
(2008). Monopolar electro-gene delivery in the thymus: restoring a functional, diversified and long-term T cell repertoire
in immunodeficient mice. PLoSONE. 3: e2059.
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IFR 137, Cancéropôle PACA
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Potentiels : Oz biosciences ; Innate Pharma
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Page 2 sur 2Plateforme Modèles murins d'analyse interaction hôte-tumeur (muCIP)
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Meguerditchian, A., & Vauclair, J. (2006). Baboons communicate with their right hand. Behavioural Brain Research, 171,
170-174.
Vauclair, J., Meguerditchian, A., & Hopkins, W.D. (2005). Hand Preferences for unimanual and coordinated Bimanual Tasks
in Baboons (Papio anubis). Cognitive Brain Research, 25, 210-216.
Meguerditchian, A., & Vauclair, J. (soumis). Ce que la communication gestuelle des primates nous apprend sur l’origine du
langage. Cerveau & Psycho.
Vauclair, J., Meguerditchian, A. (submitted). The gestural origin of language and its lateralization: theory and data from
studies in nonhuman primates.
Meguerditchian, A., & Vauclair, J. (in preparation). Vocal and gestural communication in non human primates and the
question of the origin of language.
Vauclair, J. &, Meguerditchian, A. (2006, April). Lateralization of intentional gestures in non human primates: baboons
communicate with their right hand. Oral presentation at the Evolang6 Conference, Rome, Italy.
Meguerditchian, A., & Vauclair, J. (2005, December). Laterality and intentional gestural communication in baboons (Papio
anubis). Oral presentation at the ELA Conference, Lyon, France.
Meguerditchian, A., & Vauclair, J. (2005, May). Manual asymmetries for communicative and non communicative gestures
in baboons (Papio anubis). Graphic presentation presented at the symposium "Asymmetries and Handedness", Paris,
France.
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Collaborations avec des équipes extérieures
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Page 2 sur 2STATION DE PRIMATOLOGIE
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Allami, Nadia, Yves Paulignan, Andrea Brovelli, et Driss Boussaoud. 2008. “Visuo-motor learning with combination of
different rates of motor imagery and physical practice.” Experimental Brain Research. Experimentelle Hirnforschung.
Expérimentation Cérébrale 184:105-13.
Apicella, P, E Legallet, A Nieoullon, et E Trouche. 1995. “Quantitative behavioral study of the acute and long-term effects
of two-stage bilateral 6-OHDA-induced lesions of the nigrostriatal dopaminergic system in monkeys.” Behavioral
Neuroscience 109:329-41.
Apicella, P, E Legallet, et E Trouche. 1996. “Responses of tonically discharging neurons in monkey striatum to visual
stimuli presented under passive conditions and during task performance.” Neuroscience Letters 203:147-50. A
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icella, P, E Le
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allet, et E Trouche. 1997. “Res
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onses of tonicall
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dischar
g
in
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neurons in the monke
y
striatum to
p
rimar
y
rewards delivered during different behavioral states.” Experimental Brain Research. Experimentelle Hirnforschung.
Expérimentation Cérébrale 116:456-66.
Apicella, P, S Ravel, P Sardo, et E Legallet. 1998. “Influence of predictive information on responses of tonically active
neurons in the monkey striatum.” Journal of Neurophysiology 80:3341-4.
Apicella, P L, S A Mirowitz, et J A Borrello. 1994. “Chemical shift misregistration artifact: increased conspicuity following
intravenous administration of gadopentetate dimeglumine.” Magnetic Resonance Imaging 12:675-8.
Apicella, P L, S A Mirowitz, et J C Weinreb. 1994. “Extension of vessels through hepatic neoplasms: MR and CT findings.” Radiology 191:135-6.
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- Service Ophtalmologie, CHU Timone
- ANR tecsan (technologie pour la santé) «
RETINE », collaboration avec l’ Institut de la
Vision (Paris) pour tester l’impact fonctionnel
d’implants rétiniens
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- ANR tecsan (technologie pour la santé) «
RETINE », collaboration avec le CEA leti & Biologic
pour la confection d’une nouvelle génération de
matrices d’électrodes (MEA) pour implants
rétiniens
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Hébergement et protocoles pharmacocinétiques
sur Primates
Hébergement et protocoles pharmacocinétiques
sur Primates, rongeurs et porcs
• Innate Pharma
• Synchrosome
• Trophos
• Pharmaxon
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Page 2 sur 2ANIMALERIE-CHIRURGIE
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• Levasseur, M., Carroll, M. Jones, K. T. and McDougall, A. (2007). A novel mechanism controls the Ca2+ oscillations
triggered by activation of ascidian eggs and has an absolute requirement for CDK1 activity. J. Cell Sci. 120 1763-1777.
• Hudson, C., Lotito, S. and Yasuo, H. Sequential and combinatorial inputs from Nodal, Delta2/Notch and FGF/MEK/ERK
signalling pathways establish a grid-like organisation of distinct cell identities in the ascidian neural plate. (2007).
Development 134 3527-3537.
• Essafi-Benkhadir K., Onesto C., Stebe E., Moroni C. and Pagès. G. “Tristetraprolin inhibits Ras-dependent tumor
vascularization by inducing vascular endothelial growth factor mRNA degradation.” Mol.Biol.Cell. (2007) 18, 4648-4658.
• Hope H., Bogliolo S., Arkowitz R.A. and Bassilana M. “Activation of Rac1 by the Guanine Nucleotide Exchange Factor
Dck1 Is Required for Invasive Filamentous Growth in the Pathogen Candida albicans.” Mol. Biol. Cell (2008) 19, 3638-3651
• Hofman P, Butori C, Havet K, Hofman V, Selva E, Guevara N, Santini J, and Van Obberghen-Schilling,E Prognostic
significance of cortactin levels in head and neck squamous cell carcinoma: comparison with epidermal growth factor
receptor status. Br J Cancer (2008) 98 956-64
• Arquier N, Géminard C, Bourouis M, Jarretou G, Honegger B, Paix A, and Léopold,P (2008) Drosophila ALS regulates
growth and metabolism through functional interaction with insulin-like peptides. Cell Metab 7 333-8
• Röttinger E., Saudemont A., Duboc V., Besnardeau L., McClay D. and Lepage T. (2008). FGF signals guide migration of
mesenchymal cells, control morphogenesis of the skeleton and regulate gastrulation during development of the sea
urchin embryo. Development 135 353-365.
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Page 2 sur 2ImaRIONice
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• Spéder, P., Adam, G. & Noselli, S.. Type ID unconventional myosin controls left-right asymmetry in Drosophila. Nature
(2006), 440:803-807.
• Pouyssegur J, Dayan F, Mazure NM. Hypoxia signalling in cancer and approaches to enforce tumour regression. Nature.
(2006) 441:437-43.
• Sahai E, Garcia-Medina R, Pouyssegur J, Vial E. Smurf1 regulates tumor cell plasticity and motility through degradation
of RhoA leading to localized inhibition of contractility. J Cell Biol (2006). 176:35-42.
• Chakrabandhu K, Herincs Z, Huault S, Dost B, Peng L, Conchonaud F, Marguet D, He HT, Hueber AO.. Palmitoylation is
required for efficient Fas cell death signaling. EMBO J (2007). 26:209-20
• Leopold P. and Perrimon N. “Drosophila and the genetics of the internal milieu.” Nature (2007) 450, 186-188.
• Essafi-Benkhadir K., Onesto C., Stebe E., Moroni C. and Pagès. G. “Tristetraprolin inhibits Ras-dependent tumor
vascularization by inducing vascular endothelial growth factor mRNA degradation.” Mol.Biol.Cell. (2007) 18, 4648-4658.
• Hope H., Bogliolo S., Arkowitz R.A. and Bassilana M. “Activation of Rac1 by the Guanine Nucleotide Exchange Factor
Dck1 Is Required for Invasive Filamentous Growth in the Pathogen Candida albicans.” Mol. Biol. Cell (2008) 19, 3638-3651
• Hofman P, Butori C, Havet K, Hofman V, Selva E, Guevara N, Santini J, and Van Obberghen-Schilling,E Prognostic
significance of cortactin levels in head and neck squamous cell carcinoma: comparison with epidermal growth factor
receptor status. Br J Cancer (2008) 98 956-64
• Arquier N, Géminard C, Bourouis M, Jarretou G, Honegger B, Paix A, and Léopold,P (2008) Drosophila ALS regulates
growth and metabolism through functional interaction with insulin-like peptides. Cell Metab 7 333-8
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Oui:
Unités de recherche de la région, incluant unités
CNRS, INSERM, INRA et équipes universitaires
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Oui
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Tout utilisateur inductriel
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Page 2 sur 2Plateforme d'Imagerie Commune au Site de Luminy (PICsL)
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- Lenne PF*, Wawrezinieck L*, Conchonaud F, Wurtz O, Boned A, Guo XJ, Rigneault H, He HT, Marguet D
Dynamic molecular confinement in the plasma membrane by microdomains and the cytoskeleton meshwork.
EMBO J. 2006 25:3245-56 Epub 2006 Jul 6
*equal contribution a “Must Read” article of the Faculty of 1000:
http://www.f1000biology.com/article/id/1033424/evaluation
- Djaker N, Lenne PF, Marguet D, Colonna A, Hadjur C, Rigneault H
Coherent Anti-Stokes Raman Scattering Microscopy (CARS): Instrumentation and Applications.
Nuclear Instruments & Methods in Physics Research A 2007 571:177–81 Epub 2006 Nov 7
- Chakrabandhu K, Hérincs Z, Huault S, Dost B, Peng L, Conchonaud F, Marguet D, He HT, Hueber AO
Palmitoylation is required for efficient Fas cell death signaling
EMBO J 2007 26:209-20 Epub 2006 Dec 7
- Wenger J, Gérard D, Lenne PF, Rigneault H, Dintinger J, Ebbesen TW, Boned A, Conchonaud F, Marguet D
Dual-color fluorescence cross-correlation spectroscopy in a single nanoaperture : towards rapid multicomponent
screening at high concentrations
Opt Express 2006 14:12206-12216
- Conchonaud F, Nicolas S, Amoureux MC, Ménager C, Marguet D, Lenne PF, Rougon G, Matarazzo V
Polysialylation increases lateral diffusion of neural cell adhesion molecule in the cell membrane.
J Biol Chem 2007 36:26266-26274 Epub 2007 Jul 9
- Randriamampita C, Mouchacca P, Malissen B, Marguet D, Trautmann A, Lellouch AC
A novel ZAP-70 dependent FRET based biosensor reveals kinase activity at both the immunological synapse and the
antisynapse
PloS One 2008 3:e1521- Sergé A, Bertaux N, Rigneault H, Marguet D
Spatiotemporal cartography by multiple-target tracing method probes dynamic heterogeneities in cell membranes
Nature Method 2008 in revision
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Laboratoires régionaux (IBDLM)
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Zeiss France, MaunaKea Technologies, France
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Page 2 sur 2Plateforme d'Interactions moléculaires en milieu vivant
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1. Bénar C, Schön D, Grimault S, Nazarian B, Burle B, Roth M, Badier JM, Marquis P, Liegeois-Chauvel C, Anton JL. Single-
trial
analysis of oddball event-related potentials in simultaneous EEG-fMRI. Human Brain Mapping (2007), 28(7):602-13.
2. Boulinguez P., Jaffard M., Longcamp M., Velay J.L., Anton J.L., Roth M., Nazarian B. Proactive inhibitory control of
movement assessed by event-related fMRI. NeuroImage (2008) (3):1196-206 .
3. Coull JT, Vidal F, Nazarian B, Macar F. Functional anatomy of the attentional modulation of time estimation, Science
(2004)
303: 1506-1508
4. Keysers C., Wicker B., Gazzola V., Anton JL., Fogassi L., Gallese V. A touching sight : SII/PV activation during the
observation of touch. Neuron (2004) 42(2):335-346.
5. Koechlin E, Jubault T. Broca's area and the hierarchical organization of human behavior. Neuron (2006), 50(6):963-74.
6. Longcamp M., Boucard C., Gilhodes J.C., Nazarian B., Anton J.L., Roth M., Velay J.L. Learning through hand- or type-writing
influences visual recognition of new graphic shapes: behavioral and functional imaging evidences. Journal of Cognitive
Neuroscience (2008) 20:5, pp. 802–815.
7. Monfardini E., Brovelli A., Boussaoud D., Takerkart S., Wicker B. I learned from what you did: Retrieving visuomotor
associations learned by observation. Neuroimage (2008) 42(3):1207-13.
8. Operto G., Bulot R., Anton J.L., Coulon O. Projection of fMRI data onto the cortical surface using anatomically-informed
convolution kernels. Neuroimage (2008) 39(1):127-35.
9. Perlbarg V, Bellec P, Anton JL, Pelegrini-Issac M, Doyon J, Benali H. CORSICA: Correction of structured noise in fMRI by
automatic identification of ICA components. Magnetic Resonance Imaging (2007) 25: 35-46.
10. Romaiguère P., Anton J.L., Roth M., Casini L. & Roll J.P. Motor and parietal cortical areas both underlie kinaesthesia.
Cognitive Brain Research (2003). 16 : 74-82.
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Recherches et développements en méthodologie
d'acquisition et de
traitement des données IRM, EEG,
comportementales et
physiologiques.
Travaux menés en collaboration avec des
équipes de recherche en
méthodologie et d'autres plate-formes
d'imagerie nationales.
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Collaborations également avec Bruker,
Rapid-Biomed, National Instruments,
Micromed
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Soutien et encadrement méthodologique et
technologique de
nombreux projets de recherche en
neurosciences fondamentales
et cliniques, couvrant la plupart des thèmes de
la cognition. Mise en
oeuvre des acquisitions IRM anatomiques et
fonctionnelles, ainsi
que des systèmes périphériques nécessaires à
la réalisation des
expériences. Travaux menés avec de nombreux
laboratoires locaux,
nationaux et internationaux.
Plusieurs projets de recherche en
neurosciences ont également été menés
pour les sociétés Seita et L'Oréal.
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Page 2 sur 2Plateforme d'IRM de Marseille
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• Caus T, Kober F, Mouly-Bandini A, et al. 31P MRS of heart grafts provides metabolic markers of early dysfunction. Eur J
Cardiothorac Surg 2005; 28:576-580.
• Reuter F, Del Cul A, Malikova I, et al. White matter damage impairs access to consciousness in multiple sclerosis.
Neuroimage 2009; 44:590-599.
• Bettus G, Guedj E, Joyeux F, et al. Decreased basal fMRI functional connectivity in epileptogenic networks and
contralateral compensatory mechanisms. Hum Brain Mapp 2008.
• Guye M, Ranjeva JP, Bartolomei F, et al. What is the significance of interictal water diffusion changes in frontal lobe
epilepsies? Neuroimage 2007; 35:28-37
• Tonson A, Ratel S, Le Fur Y, Cozzone P, Bendahan D. Effect of maturation on the relationship between muscle size and
force production. Med Sci Sports Exerc 2008; 40:918-925.
• Duhamel G, Callot V, Cozzone PJ, Kober F. Spinal cord blood flow measurement by arterial spin labeling. Magn Reson
Med 2008; 59:846-854
• Desrois M, Caus T, Belles PM, et al. Limitation of myocardial and endothelial injury of the rat heart graft after
preservation with Centre de Resonance Magnetique Biologique et Medicale (CRMBM) solution. Transpl Int 2008; 21:276-