Programmation Java pour le traitement et l’analyse d ...

chuckleelephantbutteΛογισμικό & κατασκευή λογ/κού

9 Ιουν 2012 (πριν από 5 χρόνια και 2 μήνες)

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Programmation Java pour le traitement et l’analyse d’images :
Création de greffons pour Image J
12-14 décembre 2011

A l’issue de la formation, les participants:
- seront en mesure d’écrire sous la forme d’un algorithme un processus à implémenter
- seront capables de paramétrer et d’utiliser un environnement de développement intégré (EDI)
Objectifs du cours - pourront concevoir et réaliser des programmes simples, autonomes, en Java
- sauront identifier les ressources utiles de l’API d’ImageJ et seront en mesure de les utiliser
-pourront étendre les potentialités du gratuiciel ImageJ au moyen de greffons qu’ils programmeront en
Java
Public concerné Personnels scientifiques en plates-formes technologiques (ITA, chercheurs, doctorants, post-doctorants).
Jour 1: Initiation au Java
-Langage Java : historique, ressources disponibles, installation du JDK
-Utilisation d’un éditeur spécialisé, JEdit pour un premier contact simple avec le langage Java
-Découverte des bases du langage Java (programmation orientée objet, structure du langage Java,
compilation et exécution…)

Jour 2 : Programmation Java pour ImageJ
-Structure des données sous ImageJ : les classes ImagePlus et ImageProcessor
-Apprentissage d’un Environnement de Programmation Intégré, NetBeans : téléchargement, installation et
paramétrage pour le développement de greffons ImageJ
Contenu
-Notion d’interface : leur rôle structurant dans la création de greffons
-Manipulation des données « intensité » contenues dans l’image (2D/3D)

Jour 3 : Programmation Java pour ImageJ (suite)
-La classe ImageStatistics : manipulation des données statistiques issues de l’image
-Questions/Réponses : séance « à la carte», dont le programme est constitué sur la base des questions
soulevées par les participants (dans le dossier d’inscription et au cours de la formation)

L’ensemble de ces notions sera abordé sous la forme d’un tutoriel pas à pas, au moyen d’exemples
évolutifs, à complexité croissante
-Etre à l’aise avec l’outil informatique
-Etre un utilisateur avancé d’ImageJ
Pré-requis
-Avoir une connaissance approfondie de la création de macro-commandes sous ImageJ
10 personnes maximum
Effectif
12-13-14 décembre 2011
9h-12h30 et 13h30-17h30
Lieu et durée
Salle PC1
Bâtiment 31, campus CNRS, Gif sur Yvette
Christophe Chamot Fabrice Cordelières
PLATIM Institut Curie - CNRS UMR 3348
Intervenants
IFR128 BioSciences Lyon-Gerland Plateforme d’Imagerie Cellulaire et Tissulaire
46, Allée d’Italie Bâtiment 112 - Centre universitaire
69364 Lyon Cedex 07 91405 Orsay Cedex
AVANT le 7 novembre 2011
Inscriptions
Informations et contact : formation.permanente@dr4.cnrs.fr
CNRS, Délégation Ile-de-France Sud
Avenue de la Terrasse
Bâtiment 9
91198 Gif sur Yvette Cedex

RTMFM - Microscopie Photonique de Fluorescence Multidimensionnelle
Organisateurs
http://rtmfm.cnrs.fr/

Mission Ressources et Compétences du CNRS
1 place Aristide BRIAND
92195 Meudon Cedex
http://www.mrct.cnrs.fr/